Det er bra utvalg av hotell i Frederikshavn. Scandic The Reef er et veldig sentralt hotell i nærheten av de viktigste turistmålene som stranden, Kruttårnet, havnen og Bangsbo.
Frederikshavn Somandshjem & Hotel er også et populært valg av overnatting til rimeligere pris. Hotellet ligger sentralt i Fredrikshavn med kort gåavstand til havnen og gågaten. Dessuten kan både Hotel Jutlandia og Danhostel Frederikshavn være gode alternativ. Det finnes også flere overnattingsmuligheter og hotell Frederikshavn. Finn tilbud på overnatting i Fredrikshavn hos Hotels.com